近日,这两项成果本月分别以“A tri-modal protein language model enables advanced protein searches”和“Democratizing protein language model training, sharing and collaboration”为题发表于Nature Biotechnology。
A tri-modal protein language model enables advanced protein searches
本研究由西湖大学原发杰实验室、常兴实验室与香港科技大学卢泓远教授团队主导完成,粟锦、何燕和游世洋为共同第一作者。项目得到了Beltrao、Ovchinnikov、Zeng、Wang、Huang等多位国内外学者的建议与指导。感谢L. Hong与M. Li提供基础数据库支持,感谢西湖大学高性能计算中心(HPC Center)在算力与技术上的持续保障。本研究受浙江省“领雁计划”、国家自然科学基金、国家重点研发计划、国家科技重大专项、广州市产学研联合资金项目以及西湖大学合成生物与集成生物工程研究中心等的资助与支持。本研究感谢所有参与者在模型算法开发、实验验证及论文修改中的共同努力。
Democratizing protein language model training, sharing and collaboration
1988年毕业于中国科学技术大学,获学士学位;在伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校(University of Illinois at Urbana–Champaign)师从 Ralph G. Nuzzo 教授与 Gregory S. Girolami 教授,于1994年获得博士学位。随后,他在西北大学(Northwestern University),作为美国国家科学基金会博士后研究员(NSF Postdoctoral Fellow)从事研究工作,师从 Tobin J. Marks 教授。
1997年至2001年在美国布兰迪斯大学(Brandeis University)化学系任助理教授;2001年至2013年在北卡罗来纳大学教堂山分校(University of North Carolina at Chapel Hill)化学系与药学院任教,历助理教授(2001–2003)、副教授(2003–2007)、教授(2007–2011)及Kenan 杰出教授(2011–2013)。2013年起加入芝加哥大学,任化学系与放射与细胞肿瘤学系詹姆斯·弗兰克讲席教授。2025年加入西湖大学,任化学讲席教授,可持续发展与人类健康分子材料实验室负责人。